Les bajoyers sont les deux murs verticaux, en maçonnerie, en béton ou parfois en palplanches, qui forment les côtés du sas. Ils logent les portes dans des enclaves aux têtes de l'écluse et portent les équipements d'amarrage : bollards en couronnement, bollards encastrés à plusieurs hauteurs, échelles.
Pendant l'éclusage, le bateau reste le long d'un bajoyer, protégé par des défenses. À la montée, l'eau qui entre agite le bateau et la coque peut se coincer sous une saillie du mur : on garde l'aussière tendue pour rester près du bajoyer sans s'y accrocher. Comme on ne sait pas toujours de quel bord on sera placé, on prépare les deux côtés.
Les bajoyers servent aussi de support à la signalisation d'écluse, fixée par platines ou brides en accord avec le gestionnaire.